請問如何得知或是搜尋到沒有特定點的機票？

因為在安排長時間的旅程，安排上有些沒有特定停留的點
我的想法是：洲與洲之間，若非得坐飛機，希望可以知道或是搜尋到最便宜的機票
如，我想從澳洲東部布里斯本或是雪梨，到東南亞，可以是新加坡或是馬來西亞的吉隆坡
目前比較接近我想法的搜尋網站是http://www.skyscanner.com.tw/
有點像是我到A點之後，看到哪個洲的哪個地點移動需要購買的機票錢比較便宜，我就移動B點，接下來就大致以陸路移動，直到要橫跨海域。

但我有個疑問：
我在選擇航班上，勾選直飛>>>這樣就與一般所說的轉機越多，機票錢越便宜，有所衝突
因此找到的資訊，似乎價錢都不漂亮...

再來就是，通常得要知道最終目的地，而它可以經由哪些城市轉機到達！
如，最近朋友要去柏林念書，台灣出發，可以直飛，或轉機1次經由曼谷或阿姆斯特丹轉機(當然還有轉機2次以上的)
朋友選擇到阿姆斯特丹轉機1次，價錢和時間才可以接受。

總結我的疑惑，因為不想購買環球機票(口袋不夠深)，想要靠坐廉價航空分段式購買機票
不知道有沒有哪個搜尋系統比較強大？
預計澳洲>>東南亞>>亞西>>南歐/中歐(經陸路)>>(經海路)北非>>美東>>中南美洲
還是我想得太天真了，這樣搞不好沒有比較省 ><
先謝謝大家