請教轉機程序

劈腿年代何為真愛
上個月底從智利聖地牙哥回桃園,航班是這樣的
聖地牙哥-->奧克蘭(智利航空)
奧克蘭-->布里斯本(澳洲航空)
布里斯本-->桃園(長榮)
在聖地牙哥check in 時,智利航空地勤說他的系統登機證只能印出前兩段,行李也只能掛到布里斯本
我在布里斯本下空橋後跟著指標走,後來有2個方向,一個是入境(提領行李),一個國際轉機,我選擇國際轉機那邊,過安檢後,就到gate,免稅商店區了,我沒有看到長榮的轉機櫃檯,所以也沒有布里斯本-->桃園的登機證,有看到澳航的轉機櫃檯,問了一下,他們說可以在登機前1小時在gate印出登機證,行李的話,澳航要我找長榮,沒登機證心裡有點慌
後來我找到機票上長榮布里斯本分公司的電話,打過去,職員也是說登機前一小時可以在gate印出登機證,我再問他那我行李呢?他說要我提領在check in ,我跟他說我沒澳簽,所以沒辦法入境提領行李,他才要我把前段行李tag號碼給他他要去幫我找,後來果真是登機前一小時地勤到櫃檯,呼叫我,把登記證印出,行李他們也有幫我重掛,另給了行李tag號碼(寫在紙上),問題才解決
我的問題是
1.依我的情況,在布里斯本過轉機安檢後,航空公司沒有轉機櫃檯是正常的嗎?如果我沒有做什麼動作,那長榮知道我要從布里斯本-->桃園嗎?
2.如果我沒打電話給長榮布里斯本分公司,登機前一小時長榮gate有辦法幫我重掛行李嗎?(我那時的行李應該是在轉盤區沒人提領)
3.如果不同聯盟,有一段登機證沒印出,也沒有轉機櫃檯,轉機程序是到時到gate去印就可以了嗎?

我這次去程是
桃園-->香港(長榮)
香港-->雪梨(澳航)
雪梨-->聖地牙哥(智利航空)
原本在桃園check in 時,長榮地勤本來說行李只能掛到香港,香港之後要我自己在重掛,因為我之前問過開票的旅行社,他跟我說可以直掛,跟地勤確認許久,才辦好桃園掛到智利,回程智利航空就跟我說只能掛到布里斯本了,因為之前跟旅行社確認可以直掛,所以就沒辦澳簽,導致在布里斯本沒辦法入境提領行李在掛
以上問題與狀況,提出來分享,也請前輩們解惑